新型人工智能,針對(duì)識(shí)別藥物活性

人工智能可以先尋找天然產(chǎn)物的可能的目標(biāo)蛋白,然后根據(jù)相關(guān)的反應(yīng)模式尋找具有類似效果的簡(jiǎn)單化學(xué)分子。與傳統(tǒng)篩選方法相比,使用這種方法找到具有醫(yī)學(xué)意義的活性成分和目標(biāo)蛋白對(duì)的機(jī)會(huì)要大得多。

近年來,隨著科技的不斷發(fā)展,人工智能與醫(yī)療的結(jié)合越來越多,并衍生出許多基于人工智能技術(shù)的前沿醫(yī)學(xué)技術(shù)和醫(yī)療器械,比如醫(yī)療影像的人工智能分析,疾病智能診斷,人工智能手術(shù)機(jī)器人,人工智能輔助藥物研發(fā)等。

就人工智能輔助藥物研發(fā)而言,一直以來,藥物研發(fā)都存在研發(fā)周期長(zhǎng)、成本高、成功率低的問題。在高投入下,醫(yī)藥研發(fā)往往很難得到理想的回報(bào),特別是在藥物發(fā)現(xiàn)階段,需要進(jìn)行大量的數(shù)據(jù)分析、篩選等工作,才能有一個(gè)正確的開端。而人工智能技術(shù)能夠大幅縮短藥物篩選時(shí)間,提升藥物篩選的精準(zhǔn)性。

近日,蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的研究人員就開發(fā)了一種新型人工智能,其能夠針對(duì)性地識(shí)別天然產(chǎn)物的生物活性,然后找到與之具有相同效果但更易于制造的化合物分子。

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在當(dāng)今新藥的開發(fā)中,很大一部分研究都是在模仿某些天然存在的物質(zhì),因?yàn)榇蠖鄶?shù)天然產(chǎn)品都是通過進(jìn)化機(jī)制選擇后,存在某種活性成分才能持續(xù)存在至今的。然而,許多天然產(chǎn)物的生物活性都是未知的,且具有的藥理活性稀缺。

例如青霉素的發(fā)現(xiàn),改寫了人類的醫(yī)學(xué)史。但是在很多情況下,即便找到了這種潛在的有效物質(zhì),因?yàn)樘崛±щy,數(shù)量稀少,也難以投入實(shí)際的臨床治療中。這時(shí)候,往往只能用過程復(fù)雜的生物培養(yǎng)獲取,這使得新藥就算可以投入臨床治療,也很難投入工業(yè)化批量生產(chǎn)。

于是,研究人員以海洋鏈霉菌中的化合物marinopyrole A為設(shè)計(jì)模板,按照計(jì)算建議的合成路線,構(gòu)建了可分三步合成的創(chuàng)新小分子。計(jì)算活性預(yù)測(cè)顯示環(huán)氧合酶(COX)是marinpyrrole a和de novo設(shè)計(jì)的假定靶點(diǎn)。

這些分子設(shè)計(jì)被實(shí)驗(yàn)證實(shí)為是具有納摩爾效價(jià)的選擇性COX-1抑制劑,X射線結(jié)構(gòu)分析揭示了最具選擇性的化合物與COX-1的結(jié)合。經(jīng)過實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證,marinopyrrole A確實(shí)可與大多數(shù)預(yù)測(cè)的蛋白質(zhì)產(chǎn)生了可測(cè)量的相互作用。

也就是說,該人工智能可以先尋找天然產(chǎn)物的可能的目標(biāo)蛋白,然后根據(jù)相關(guān)的反應(yīng)模式尋找具有類似效果的簡(jiǎn)單化學(xué)分子。與傳統(tǒng)篩選方法相比,使用這種方法找到具有醫(yī)學(xué)意義的活性成分和目標(biāo)蛋白對(duì)的機(jī)會(huì)要大得多。

可以說,天然產(chǎn)品啟發(fā)合成分子代表了一種生態(tài)和經(jīng)濟(jì)上可持續(xù)發(fā)展,機(jī)器智能的全新設(shè)計(jì)彌合了生物活性天然產(chǎn)物和合成分子之間的鴻溝。未來,希望這一研究能助力醫(yī)藥的研發(fā)。

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