近日,華點(diǎn)云受邀參加上海分子病理新技術(shù)進(jìn)展與應(yīng)用高峰論壇,就CelBox(基因解讀智能盒子,以下簡(jiǎn)稱“CelBox”)在臨床分子病理中的應(yīng)用做了精彩演講,并在會(huì)上透露將攜手阿里云共建分子病理云平臺(tái),解決病理“最后一公里”。
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隨著分子診斷技術(shù)的發(fā)展,也將病理學(xué)帶入分子病理學(xué)時(shí)代,對(duì)疾病的病因、發(fā)生、發(fā)展、發(fā)病機(jī)制以及形態(tài)變化,已從傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)診斷深入到蛋白質(zhì)和核酸水平。可以獲得疾病的易感性、鑒別診斷、預(yù)后分析、個(gè)性化治療以及預(yù)測(cè)、感染檢測(cè)、遺傳性疾病的診斷和個(gè)體識(shí)別等具有診斷與指導(dǎo)性的內(nèi)容。
病理診斷是疾病診斷的重要依據(jù),約70% 的臨床診斷需要依賴于病理診斷結(jié)果。病理醫(yī)生也被神圣的稱之為“醫(yī)生的醫(yī)生”。但由于我國(guó)醫(yī)院數(shù)量大,醫(yī)療水平參差不齊,加之病理醫(yī)生又非常的稀缺(有研究統(tǒng)計(jì),我國(guó)病理醫(yī)生的缺口總數(shù)估計(jì)在10萬(wàn)人左右),為病理學(xué)新技術(shù)的發(fā)展形成制約。
要解決這一資源缺口,一方面是要重視病理醫(yī)生的培養(yǎng),另一方面,“互聯(lián)網(wǎng)+”數(shù)字化病理分析技術(shù)為解決這一難題帶來(lái)機(jī)遇。
華點(diǎn)云牽手阿里云、上海譽(yù)源生物,共同構(gòu)建分子病理云平臺(tái)(以下簡(jiǎn)稱“病理云”),幫助病理醫(yī)生快速分析并交付檢測(cè)報(bào)告。
阿里云在云計(jì)算、大數(shù)據(jù)領(lǐng)域有著豐富的經(jīng)驗(yàn)和積累。與其合作,可以有效的解決病理云在數(shù)據(jù)傳輸、處理、安全保護(hù)、高并發(fā)等方面嚴(yán)苛的要求。
病理云將前沿的生信技術(shù)、大數(shù)據(jù)技術(shù)、云計(jì)算技術(shù)相結(jié)合,把數(shù)據(jù)分析到報(bào)告出具的繁瑣過(guò)程程序化、流程化、自動(dòng)化,一鍵上傳數(shù)據(jù)到病理云,可自動(dòng)化運(yùn)行分析,幾分鐘甚至幾秒鐘就可以出具檢測(cè)報(bào)告,并自動(dòng)化的交付到醫(yī)院的病理系統(tǒng)中。無(wú)需專業(yè)的分析與報(bào)告解決人員,即可輕松的搞定病理報(bào)告,為廣大的病理醫(yī)生提供全新、靈活、便捷的報(bào)告交付體驗(yàn)。
同時(shí),病理云將部署華點(diǎn)云現(xiàn)已經(jīng)開發(fā)完成并經(jīng)臨床驗(yàn)證的生信分析流程、數(shù)據(jù)庫(kù)、IT算法,并根據(jù)臨床需求、病理科需求,不斷的迭代并完善病理云中的應(yīng)用,最大化的為病理醫(yī)生提供便捷。
現(xiàn)在,分子病理云已經(jīng)上線(網(wǎng)址:pathology.celloud.cn),華點(diǎn)云誠(chéng)摯邀請(qǐng)病理醫(yī)生進(jìn)行內(nèi)測(cè),共同推進(jìn)分子病理的健康發(fā)展。
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華點(diǎn)云自主研發(fā)的另一產(chǎn)品CelBox基因解讀智能盒子,作為數(shù)據(jù)處理本地化產(chǎn)品,也可以幫助醫(yī)院實(shí)現(xiàn)從測(cè)序數(shù)據(jù)到分析、解讀、報(bào)告交付一體化的解決方案。
CelBox是集計(jì)算機(jī)軟、硬件為一體。部署的生信算法參考國(guó)際權(quán)威算法,生信流程經(jīng)過(guò)多專家審核、軟件評(píng)估、多年臨床驗(yàn)證,并加入經(jīng)過(guò)整理的國(guó)際權(quán)威數(shù)據(jù)庫(kù)與中國(guó)人特有數(shù)據(jù)庫(kù),以保證數(shù)據(jù)解讀的準(zhǔn)確性;同時(shí),硬件與著名廠商合作進(jìn)行設(shè)計(jì)優(yōu)化、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,以滿足不同檢測(cè)項(xiàng)目的需求,確保數(shù)據(jù)計(jì)算的高效性與存儲(chǔ)的穩(wěn)定性。
CelBox有著健全的安全控制體系,如硬件物理安全、網(wǎng)絡(luò)安全、應(yīng)用安全等。
CelBox可以幫助醫(yī)院對(duì)接眾多基因檢測(cè)項(xiàng)目、分析流程以及數(shù)據(jù)格式。包括:
檢測(cè)項(xiàng)目:腫瘤個(gè)體化治療和用藥檢測(cè)、病原菌感染檢測(cè)、遺傳代謝病檢測(cè)、慢病檢測(cè);
檢測(cè)分析方法:16S/18S/ITS、WGS、轉(zhuǎn)錄mRNA、全外顯子、宏基因組、目標(biāo)區(qū)域;
檢測(cè)平臺(tái):基因芯片、PCR技術(shù)、FISH技術(shù)、Sanger測(cè)序技術(shù)、NGS;
數(shù)據(jù)格式:SAM、BAM、TXT、XLS、FASTA、FASTQ、ABI、VCF。
CelBox已經(jīng)獲得了多項(xiàng)專利與軟著。如鑒定細(xì)菌的多重PCR引物對(duì)組合及鑒定方法、高通量測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)方法和統(tǒng)計(jì)裝置、樣本管理系統(tǒng)、分析流程管理系統(tǒng)、項(xiàng)目網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)等等,
以及中國(guó)質(zhì)量認(rèn)證中心頒發(fā)的3C認(rèn)證證書。
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華點(diǎn)云以解決用戶的實(shí)際需求為出發(fā),搭建準(zhǔn)確、有價(jià)值且可直接應(yīng)用于臨床的準(zhǔn)確醫(yī)療產(chǎn)品及服務(wù)體系,并提供整體化的解決方案。華點(diǎn)云也希望通過(guò)分子病理云,推進(jìn)分子病理的快速發(fā)展,為醫(yī)療事業(yè)做貢獻(xiàn)。